Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXC3

Mgme1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgme1Q9CXC3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mgme1Q9CXC3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mgme1Q9CXC3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms