Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms