Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Prkrip1Q9CWV6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms