Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddx28Q9CWT6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms