Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWP4

Ly6k, Lymphocyte antigen 6K, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6kQ9CWP4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ly6kQ9CWP4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ly6kQ9CWP4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ly6kQ9CWP4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ly6kQ9CWP4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ly6kQ9CWP4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ly6kQ9CWP4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ly6kQ9CWP4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ly6kQ9CWP4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ly6kQ9CWP4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ly6kQ9CWP4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ly6kQ9CWP4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ly6kQ9CWP4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ly6kQ9CWP4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ly6kQ9CWP4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ly6kQ9CWP4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ly6kQ9CWP4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ly6kQ9CWP4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ly6kQ9CWP4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ly6kQ9CWP4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ly6kQ9CWP4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ly6kQ9CWP4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ly6kQ9CWP4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms