Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atxn3Q9CVD2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms