Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ5

4930524J08Rik, RIKEN cDNA 4930524J08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930524J08RikQ9CUJ5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
4930524J08RikQ9CUJ5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930524J08RikQ9CUJ5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms