Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Otud1Q9CUB6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otud1Q9CUB6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms