Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sft2d3Q9CSV6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Sft2d3Q9CSV6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sft2d3Q9CSV6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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