Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rprd1bQ9CSU0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms