Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snw1Q9CSN1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snw1Q9CSN1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
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