Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS42

Prps2, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prps2Q9CS42 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Prps2Q9CS42 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prps2Q9CS42 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prps2Q9CS42 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prps2Q9CS42 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prps2Q9CS42 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Prps2Q9CS42 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prps2Q9CS42 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prps2Q9CS42 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prps2Q9CS42 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prps2Q9CS42 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prps2Q9CS42 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prps2Q9CS42 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prps2Q9CS42 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prps2Q9CS42 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prps2Q9CS42 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prps2Q9CS42 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prps2Q9CS42 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prps2Q9CS42 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Prps2Q9CS42 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prps2Q9CS42 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prps2Q9CS42 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prps2Q9CS42 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prps2Q9CS42 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prps2Q9CS42 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prps2Q9CS42 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prps2Q9CS42 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prps2Q9CS42 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms