Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRW3

UPF0538 protein C2orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRW3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CRW3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CRW3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CRW3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CRW3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CRW3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CRW3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CRW3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CRW3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms