Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR52

4933400A11Rik, RIKEN cDNA 4933400A11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933400A11RikQ9CR52 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933400A11RikQ9CR52 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933400A11RikQ9CR52 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
4933400A11RikQ9CR52 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933400A11RikQ9CR52 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933400A11RikQ9CR52 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933400A11RikQ9CR52 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933400A11RikQ9CR52 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933400A11RikQ9CR52 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms