Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PompQ9CQT5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PompQ9CQT5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms