Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nicn1Q9CQM0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nicn1Q9CQM0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nicn1Q9CQM0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nicn1Q9CQM0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nicn1Q9CQM0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nicn1Q9CQM0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nicn1Q9CQM0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nicn1Q9CQM0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nicn1Q9CQM0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Nicn1Q9CQM0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nicn1Q9CQM0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nicn1Q9CQM0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nicn1Q9CQM0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nicn1Q9CQM0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nicn1Q9CQM0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nicn1Q9CQM0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nicn1Q9CQM0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nicn1Q9CQM0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nicn1Q9CQM0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nicn1Q9CQM0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nicn1Q9CQM0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nicn1Q9CQM0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nicn1Q9CQM0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nicn1Q9CQM0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nicn1Q9CQM0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nicn1Q9CQM0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nicn1Q9CQM0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nicn1Q9CQM0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nicn1Q9CQM0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nicn1Q9CQM0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nicn1Q9CQM0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nicn1Q9CQM0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nicn1Q9CQM0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nicn1Q9CQM0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nicn1Q9CQM0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nicn1Q9CQM0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nicn1Q9CQM0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nicn1Q9CQM0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Nicn1Q9CQM0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Nicn1Q9CQM0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nicn1Q9CQM0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nicn1Q9CQM0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Nicn1Q9CQM0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Nicn1Q9CQM0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Nicn1Q9CQM0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nicn1Q9CQM0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nicn1Q9CQM0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nicn1Q9CQM0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nicn1Q9CQM0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nicn1Q9CQM0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nicn1Q9CQM0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Nicn1Q9CQM0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Nicn1Q9CQM0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Nicn1Q9CQM0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Nicn1Q9CQM0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Nicn1Q9CQM0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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Nicn1Q9CQM0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Nicn1Q9CQM0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Nicn1Q9CQM0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Nicn1Q9CQM0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nicn1Q9CQM0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nicn1Q9CQM0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nicn1Q9CQM0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nicn1Q9CQM0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nicn1Q9CQM0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nicn1Q9CQM0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nicn1Q9CQM0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nicn1Q9CQM0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nicn1Q9CQM0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nicn1Q9CQM0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nicn1Q9CQM0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nicn1Q9CQM0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nicn1Q9CQM0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nicn1Q9CQM0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nicn1Q9CQM0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nicn1Q9CQM0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nicn1Q9CQM0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nicn1Q9CQM0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nicn1Q9CQM0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nicn1Q9CQM0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Nicn1Q9CQM0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nicn1Q9CQM0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nicn1Q9CQM0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nicn1Q9CQM0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Nicn1Q9CQM0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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