Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

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Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rdm1Q9CQK3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rdm1Q9CQK3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms