Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snrpb2Q9CQI7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snrpb2Q9CQI7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snrpb2Q9CQI7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snrpb2Q9CQI7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snrpb2Q9CQI7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snrpb2Q9CQI7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snrpb2Q9CQI7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snrpb2Q9CQI7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snrpb2Q9CQI7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snrpb2Q9CQI7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snrpb2Q9CQI7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Snrpb2Q9CQI7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snrpb2Q9CQI7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snrpb2Q9CQI7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snrpb2Q9CQI7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snrpb2Q9CQI7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snrpb2Q9CQI7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Snrpb2Q9CQI7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snrpb2Q9CQI7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snrpb2Q9CQI7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snrpb2Q9CQI7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snrpb2Q9CQI7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snrpb2Q9CQI7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snrpb2Q9CQI7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snrpb2Q9CQI7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snrpb2Q9CQI7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snrpb2Q9CQI7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snrpb2Q9CQI7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snrpb2Q9CQI7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snrpb2Q9CQI7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms