Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQF4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQF4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQF4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQF4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CQF4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CQF4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9CQF4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CQF4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CQF4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CQF4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CQF4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CQF4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms