Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nudt21Q9CQF3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
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