Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9CQC3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9CQC3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9CQC3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CQC3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CQC3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CQC3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9CQC3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9CQC3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9CQC3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9CQC3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q9CQC3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q9CQC3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q9CQC3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q9CQC3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CQC3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CQC3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CQC3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CQC3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CQC3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms