Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA5

Med4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med4Q9CQA5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Med4Q9CQA5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Med4Q9CQA5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms