Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
Pkp2Q9CQ73 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms