Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gtf2a1Q99PM3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms