Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scd3Q99PL7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms