Protein–RNA interactions for Protein: Q99PI8

Rtn4r, Reticulon-4 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4rQ99PI8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtn4rQ99PI8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtn4rQ99PI8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtn4rQ99PI8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtn4rQ99PI8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtn4rQ99PI8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtn4rQ99PI8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtn4rQ99PI8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtn4rQ99PI8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtn4rQ99PI8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtn4rQ99PI8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtn4rQ99PI8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtn4rQ99PI8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtn4rQ99PI8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtn4rQ99PI8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtn4rQ99PI8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtn4rQ99PI8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtn4rQ99PI8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtn4rQ99PI8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtn4rQ99PI8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtn4rQ99PI8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtn4rQ99PI8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtn4rQ99PI8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtn4rQ99PI8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtn4rQ99PI8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtn4rQ99PI8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtn4rQ99PI8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtn4rQ99PI8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtn4rQ99PI8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtn4rQ99PI8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtn4rQ99PI8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtn4rQ99PI8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtn4rQ99PI8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtn4rQ99PI8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtn4rQ99PI8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtn4rQ99PI8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtn4rQ99PI8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtn4rQ99PI8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtn4rQ99PI8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtn4rQ99PI8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtn4rQ99PI8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtn4rQ99PI8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtn4rQ99PI8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms