Protein–RNA interactions for Protein: Q99P51

Rassf3, Ras association domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf3Q99P51 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Rassf3Q99P51 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rassf3Q99P51 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rassf3Q99P51 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rassf3Q99P51 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rassf3Q99P51 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rassf3Q99P51 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rassf3Q99P51 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms