Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep41Q99NF3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cep41Q99NF3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms