Protein–RNA interactions for Protein: Q99NC0

Vgll1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll1Q99NC0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vgll1Q99NC0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vgll1Q99NC0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vgll1Q99NC0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vgll1Q99NC0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vgll1Q99NC0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vgll1Q99NC0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vgll1Q99NC0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vgll1Q99NC0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vgll1Q99NC0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vgll1Q99NC0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vgll1Q99NC0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vgll1Q99NC0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vgll1Q99NC0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vgll1Q99NC0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vgll1Q99NC0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Vgll1Q99NC0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vgll1Q99NC0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vgll1Q99NC0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vgll1Q99NC0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Vgll1Q99NC0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vgll1Q99NC0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vgll1Q99NC0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vgll1Q99NC0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms