Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rnf17Q99MV7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rnf17Q99MV7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rnf17Q99MV7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rnf17Q99MV7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rnf17Q99MV7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rnf17Q99MV7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rnf17Q99MV7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Rnf17Q99MV7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rnf17Q99MV7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rnf17Q99MV7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rnf17Q99MV7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rnf17Q99MV7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rnf17Q99MV7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rnf17Q99MV7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rnf17Q99MV7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Rnf17Q99MV7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rnf17Q99MV7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rnf17Q99MV7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rnf17Q99MV7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rnf17Q99MV7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rnf17Q99MV7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rnf17Q99MV7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rnf17Q99MV7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rnf17Q99MV7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rnf17Q99MV7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rnf17Q99MV7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rnf17Q99MV7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rnf17Q99MV7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rnf17Q99MV7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rnf17Q99MV7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rnf17Q99MV7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rnf17Q99MV7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rnf17Q99MV7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rnf17Q99MV7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Rnf17Q99MV7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rnf17Q99MV7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Rnf17Q99MV7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rnf17Q99MV7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rnf17Q99MV7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rnf17Q99MV7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rnf17Q99MV7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rnf17Q99MV7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rnf17Q99MV7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rnf17Q99MV7 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rnf17Q99MV7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rnf17Q99MV7 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Rnf17Q99MV7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rnf17Q99MV7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rnf17Q99MV7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rnf17Q99MV7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rnf17Q99MV7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rnf17Q99MV7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rnf17Q99MV7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rnf17Q99MV7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Rnf17Q99MV7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rnf17Q99MV7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rnf17Q99MV7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rnf17Q99MV7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rnf17Q99MV7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rnf17Q99MV7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rnf17Q99MV7 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rnf17Q99MV7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms