Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN9

Pccb, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccbQ99MN9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PccbQ99MN9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PccbQ99MN9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms