Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN1

Kars, Lysine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KarsQ99MN1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KarsQ99MN1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KarsQ99MN1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KarsQ99MN1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KarsQ99MN1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KarsQ99MN1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KarsQ99MN1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KarsQ99MN1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KarsQ99MN1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KarsQ99MN1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KarsQ99MN1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KarsQ99MN1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KarsQ99MN1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KarsQ99MN1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KarsQ99MN1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KarsQ99MN1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KarsQ99MN1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KarsQ99MN1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KarsQ99MN1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KarsQ99MN1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KarsQ99MN1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KarsQ99MN1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KarsQ99MN1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KarsQ99MN1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KarsQ99MN1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KarsQ99MN1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KarsQ99MN1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KarsQ99MN1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms