Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PtprtQ99M80 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PtprtQ99M80 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PtprtQ99M80 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PtprtQ99M80 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PtprtQ99M80 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PtprtQ99M80 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PtprtQ99M80 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PtprtQ99M80 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PtprtQ99M80 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PtprtQ99M80 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PtprtQ99M80 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PtprtQ99M80 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PtprtQ99M80 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
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PtprtQ99M80 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PtprtQ99M80 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PtprtQ99M80 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PtprtQ99M80 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PtprtQ99M80 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PtprtQ99M80 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PtprtQ99M80 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PtprtQ99M80 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PtprtQ99M80 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PtprtQ99M80 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PtprtQ99M80 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PtprtQ99M80 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PtprtQ99M80 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PtprtQ99M80 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PtprtQ99M80 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PtprtQ99M80 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PtprtQ99M80 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PtprtQ99M80 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PtprtQ99M80 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PtprtQ99M80 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PtprtQ99M80 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PtprtQ99M80 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PtprtQ99M80 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PtprtQ99M80 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PtprtQ99M80 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PtprtQ99M80 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PtprtQ99M80 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PtprtQ99M80 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PtprtQ99M80 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PtprtQ99M80 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PtprtQ99M80 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PtprtQ99M80 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PtprtQ99M80 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PtprtQ99M80 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PtprtQ99M80 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PtprtQ99M80 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PtprtQ99M80 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PtprtQ99M80 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
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