Protein–RNA interactions for Protein: Q99LS3

Psph, Phosphoserine phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsphQ99LS3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PsphQ99LS3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PsphQ99LS3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PsphQ99LS3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PsphQ99LS3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PsphQ99LS3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PsphQ99LS3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PsphQ99LS3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PsphQ99LS3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PsphQ99LS3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PsphQ99LS3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PsphQ99LS3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PsphQ99LS3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PsphQ99LS3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PsphQ99LS3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PsphQ99LS3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PsphQ99LS3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PsphQ99LS3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PsphQ99LS3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PsphQ99LS3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PsphQ99LS3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PsphQ99LS3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms