Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nmd3Q99L48 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nmd3Q99L48 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms