Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab28Q99KL7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rab28Q99KL7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms