Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Reep3Q99KK1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms