Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TrabdQ99JY4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TrabdQ99JY4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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