Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lims1Q99JW4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms