Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tlcd1Q99JT6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms