Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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Ctu1Q99J10 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
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Ctu1Q99J10 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Ctu1Q99J10 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
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Ctu1Q99J10 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
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Ctu1Q99J10 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
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Ctu1Q99J10 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctu1Q99J10 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
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