Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slc8b1Q925Q3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slc8b1Q925Q3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms