Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prpf3Q922U1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prpf3Q922U1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms