Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Clip1Q922J3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Clip1Q922J3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Clip1Q922J3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Clip1Q922J3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Clip1Q922J3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Clip1Q922J3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Clip1Q922J3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Clip1Q922J3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Clip1Q922J3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Clip1Q922J3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Clip1Q922J3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Clip1Q922J3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Clip1Q922J3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Clip1Q922J3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Clip1Q922J3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Clip1Q922J3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Clip1Q922J3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Clip1Q922J3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Clip1Q922J3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Clip1Q922J3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Clip1Q922J3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Clip1Q922J3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Clip1Q922J3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Clip1Q922J3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Clip1Q922J3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Clip1Q922J3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Clip1Q922J3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Clip1Q922J3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Clip1Q922J3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Clip1Q922J3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Clip1Q922J3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Clip1Q922J3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Clip1Q922J3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Clip1Q922J3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Clip1Q922J3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Clip1Q922J3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Clip1Q922J3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Clip1Q922J3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Clip1Q922J3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Clip1Q922J3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Clip1Q922J3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Clip1Q922J3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Clip1Q922J3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Clip1Q922J3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Clip1Q922J3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Clip1Q922J3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Clip1Q922J3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Clip1Q922J3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Clip1Q922J3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Clip1Q922J3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Clip1Q922J3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Clip1Q922J3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Clip1Q922J3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Clip1Q922J3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Clip1Q922J3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Clip1Q922J3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Clip1Q922J3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Clip1Q922J3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Clip1Q922J3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Clip1Q922J3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Clip1Q922J3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Clip1Q922J3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Clip1Q922J3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Clip1Q922J3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Clip1Q922J3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Clip1Q922J3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Clip1Q922J3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Clip1Q922J3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Clip1Q922J3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Clip1Q922J3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Clip1Q922J3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Clip1Q922J3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Clip1Q922J3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Clip1Q922J3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Clip1Q922J3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Clip1Q922J3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Clip1Q922J3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Clip1Q922J3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Clip1Q922J3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Clip1Q922J3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Clip1Q922J3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Clip1Q922J3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Clip1Q922J3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Clip1Q922J3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Clip1Q922J3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Clip1Q922J3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Clip1Q922J3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Clip1Q922J3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Clip1Q922J3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Clip1Q922J3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Clip1Q922J3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Clip1Q922J3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Clip1Q922J3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Clip1Q922J3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Clip1Q922J3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Clip1Q922J3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Clip1Q922J3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Clip1Q922J3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Clip1Q922J3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms