Protein–RNA interactions for Protein: Q921E6

Eed, Polycomb protein EED, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EedQ921E6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EedQ921E6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EedQ921E6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EedQ921E6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EedQ921E6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EedQ921E6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EedQ921E6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EedQ921E6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EedQ921E6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EedQ921E6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EedQ921E6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EedQ921E6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EedQ921E6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EedQ921E6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
EedQ921E6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EedQ921E6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EedQ921E6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EedQ921E6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EedQ921E6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EedQ921E6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EedQ921E6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EedQ921E6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EedQ921E6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EedQ921E6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EedQ921E6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EedQ921E6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms