Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Afg3l1Q920A7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Afg3l1Q920A7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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