Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarca5Q91ZW3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smarca5Q91ZW3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarca5Q91ZW3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms