Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD5

Cts3, Cathepsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts3Q91ZD5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cts3Q91ZD5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cts3Q91ZD5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms