Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Basp1Q91XV3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Basp1Q91XV3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms