Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Setd3Q91WC0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Setd3Q91WC0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms